捉鬼天师钟九身背三把刀，率徒弟在树林与树妖姥姥、小倩等狭路相逢。钟九误认小倩勾引凡人欲降妖，反遭姥姥反击，他与徒弟秋收、文财魂魄被吸。小倩执行吸阳任务时，在湖中心与旧爱燕赤霞重逢，道出全家遇害、自己被姥姥控制的悲惨过往。燕赤霞决心救她。书生宁采臣进京赶考因盘缠不足去收账，途中被抓壮丁，幸得燕赤霞解救。三人至兰若寺借宿，宁采臣与小倩相遇，小倩为其善良打动，倾诉不幸。姥姥因小倩未抓人问罪，宁采臣护小倩，致小倩为救他魂飞魄散。燕赤霞怒战姥姥与黑山老妖，除掉二者。宁采臣求其救小倩无果，燕赤霞将小倩骨灰交予他后，回小倩消散之地自刎。宁采臣带着小倩骨灰踏上归程，故事落幕。
